转基因作物的推广种植，会对农药使用量造成增加还是减少，是全球的业内人士普遍关注的问题，专业人士对此的研究与争议也一直存在。近日有两份关于转基因作物上使用农药用量情况的研究报告有相反的数据。其中美国Organic Center认为种植转基因作物后，1996年到2008年美国农药使用量增加3.184亿lbs（14.4424万吨）。但是，英国PG Economics指出1996年到2007年全球转基因作物上农药使用量减少35.9万吨。
上述两份研究均发现种植转基因Bt抗虫棉花和玉米后，两种作物上的农药使用量急剧减少。但是美国报告指出耐除草剂作物增加了除草剂的使用，而英国研究认为除草剂使用量减少。
美国研究承认转基因作物推出前3年，农药使用量减少。但最近几年由于耐除草剂作物的大面积种植，农药需求量急剧增多。过去13年耐除草剂作物上的除草剂使用量增加3.826亿lbs，其中2008年比2007年增加46%。
PG Economics认为，1996年到2007年转基因大豆上的除草剂使用量减少7.3万吨。转基因玉米和棉花上的除草剂使用量分别减少8.18万吨和3.7万吨。
